首先，老年人的牙龈萎缩。牙齿由于长期的磨损引起脱落，咀嚼发生困难，使食物未能被充分咀嚼粉碎就被吞咽到胃中，从而加重胃的负担。

其次，老年人消化道黏膜、腺体均在萎缩。口腔黏膜萎缩使味觉迟钝，导致老人喜欢吃一些难以消化的厚味食物；唾液腺萎缩导致每日唾液的分泌量降为年轻人的1/3；胃液的分泌液下降为年轻时的1/5。老年人消化液中不但消化酶含量减少，而且其活性也明显降低，肝胆功能下降，胰酶分泌量和活性下降，胆汁分泌减少。胰酶可以帮助蛋白质、脂肪、淀粉三类物质消化吸收，胆汁能帮助最难消化吸收的脂肪类物质乳化，促进食物被胰脂肪酶分解和利用。胰酶和胆汁的减少，都使得肠胃消化食物的能力大大下降，故可引起消化不良。

再者，胃肠道平滑肌纤维萎缩，弹力减弱，胃肠缓慢性扩张以及胃肠道蠕动缓慢无力，使老年人的机械性消化能力减弱。研究表明，在非溃疡性消化不良的患者中，半数以上老年患者存在胃排空延迟或障碍等现象。